工程审计的内容主要包括以下几个方面：
中标通知书和招标文件审计
确保中标通知书内容明确，告知是否中标及合同签订时间和地点。
审查招标文件（工程量清单），核实计价方式和报价与技术标的关系。
图纸会审记录和监理工程师通知审计
检查图纸会审记录和监理工程师的通知或业主施工指令。
合同审计
审查合同双方权利和义务是否符合法律规定。
设计变更和工程结算审计
分析投资效益，评估项目的社会效益和经济效益。
材料用量及价差、隐蔽验收记录审计
审核材料用量及价差，审查隐蔽验收记录。
竣工财务决算报表和说明书审计
确保报表和说明书的完整性、真实性。
建设投资支出审计
审查各项建设投资支出的真实性、合规性。
建设工程竣工结算审计
核实竣工结算的真实性和合规性。
概算执行情况审计
检查概算执行情况是否符合规定。
交付使用资产审计
确认交付使用资产的真实性和完整性。
结余资金及基建收入审计
审查结余资金及基建收入的情况。
尾工工程审计
对尾工工程进行审计，确保工程质量和进度。
前期准备和施工阶段审计
包括项目审批文件、资金来源、质量控制、监理工作、施工单位选择等。
投资决策审计
审查建设项目的资金来源是否落实、合理及专户存储。
工程造价和竣工财务决算审计
造价审计关注单项、单位工程的造价审核。
竣工财务决算审计关注所有支出加总后的合理性审查。
工程审计的目的是确保工程的合规性、效益性，并符合相关法律法规的要求。