公司开票有限制的原因主要包括以下几点：
发票总额限制
公司每月所能开具的发票数量（即发票总额）是有限制的，这个限额通常是根据公司的销量来衡量的。国税局会根据实际销售数量金额来审批开票限额。如果销量未达到预期，税局会限定购买发票的数量和开票限额；如果销售增长，需要增加票量或开票限额，则需要重新申请，大约5个工作日审批通过。
达到纳税限额
纳税人不能开票的原因可能包括已达到设定的开票限额，无法享受相应的税收优惠，从而可能托辞说无法开具普通发票。
涉税风险或发票管理风险
税局可能认为企业存在涉税风险或发票管理风险，从而关闭企业的开票权限。这种情况下，企业应当与主管税务机关联系。
离线开具期限和金额
企业不能开票的原因可能包括已超过设定的离线开具期限、累计离线开具金额或上传截止日期。
开票员权限问题
如果开票员没有开具某种发票的权限，企业也将无法开具该类发票。
发票库存不足
如果企业所开具的发票类型无库存，需要购买发票，也会导致无法开票。
系统故障或操作问题
企业不能开票的原因可能还包括开票系统故障或开票员临时有事无法开票。
法律和政策限制
根据《增值税专用发票使用规定》，专用发票实行最高开票限额管理，最高开票限额由一般纳税人申请，税务机关依法审批。不同级别的最高开票限额由不同级别的税务机关审批。
防止恶意开票
国税局控制税票额度是为了防止个别企业恶意开出大额发票，造成国家税源的流失。因此，国税局对专票的最高开票限额进行了管理。
月度或年度限额
除了月度限额，有些地区或某些发票类型可能还有一年的总开票限额，这是为了确保合理使用发票资源，并控制纳税人的开票行为。
综上所述，公司开票有限制主要是为了控制税收、防止滥用发票、管理风险以及保障国家税源。企业应根据自身销售情况和实际需求，合理申请和调整开票限额。