公司或组织在决定起诉员工时，应当遵循以下步骤和注意事项：
准备起诉状和相关证据材料
起诉状应包括当事人的身份信息、诉讼请求、事实与理由等内容。
收集并提交与案件相关的证据材料，例如劳动合同、工资单、工作表现评估、公司规章制度等。
确定管辖法院
根据《民事诉讼法》的规定，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
对法人或其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。
提交起诉并缴纳诉讼费
用人单位应携带仲裁裁决书、起诉书到基层法院立案庭立案，并提交相关证据。
法院经审查，符合立案条件的，同意立案，并下发立案回执。
参与诉讼活动
按照法院的通知准时出席参与诉讼活动，包括庭审、调解等。
如果不服一审判决或裁定，应在规定时间内向上一级法院提起上诉。
执行判决
如败诉方不主动履行生效裁判文书确定的义务，胜诉方可依法申请强制执行。
注意事项
起诉前应仔细审查案件材料，确保诉讼请求明确、事实清楚、理由充分。
重视应诉策略，避免缺席应诉，以免处于不利地位。
在诉讼过程中，保持与法院的沟通，及时提供补充证据或材料。
通过以上步骤，公司或组织可以依法向法院提起诉讼，维护自身的合法权益。在整个过程中，确保所有行为均符合《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规的规定，以保证诉讼的合法性和有效性。