办理商铺房产证的流程如下：
初始登记
开发商在商品房交付使用之日起60日内，将其办理房产证所需材料报送房屋所在地房地产行政主管部门。
填写申请表
申请人需要填写申请表，填写后需开发商签字盖章。有的开发商提供已盖好章的表格，申请人直接领取并填写即可。
领取测绘图或测绘表
申请人可以到开发商指定的房屋面积计量站申请并领取测绘表，或者带身份证直接到开发商处领取。
领取相关证件
申请人需明确需要领取哪些必要的申请文件，并确保一次齐全。这些文件通常包括购房合同、房屋结算单、大房产证复印件等。
缴纳相关费用
包括公共维修金、契税等。缴纳费用时需保留好凭证，这些凭证是办理房产证的必需文件。
领取房产证
按照通知的时间到指定地点领取房产证。
建议：
提前与开发商沟通，了解初始登记的具体情况和所需材料，以确保流程顺利进行。
保留好所有缴纳凭证和申请表，避免遗失影响办理进度。
在领取房产证时，仔细核对证书上的信息，确保无误。