司法行政系统主要包括以下部分：
法院：
负责案件的审理和判决。
检察院：
负责案件的侦查和法律监督。
公安机关：
负责案件的侦查破案。
司法局：
负责监督和指导全国的监狱执行刑罚、改造罪犯的工作，监督和指导全国劳动教养工作，制定全国法制宣传教育和普及法律常识规划并组织实施，指导和检查各地区、各行业的依法治理工作，监督和指导全国的律师工作和法律顾问工作。
此外，从更广义的角度来看，司法行政系统还可能包括其他与司法相关的组织和功能部门，例如监狱管理局、劳动教养机关、公证机关、律师组织等。
综上所述，司法行政系统是一个涵盖多个司法和相关职能部门的广泛体系，其主要职责是监督、管理和指导全国的司法活动，确保法律的公正实施和普及。